Т.П. Федулова, Ю.Н. Исаков, О.М. Корчагин, И.Ю. Исаков, А.М. Кондратьева, С.Г. Ржевский
Скачать
№ 4 (28)
Естественные науки и лес
В статье обсуждается использование микросателлитных (SSR) маркеров для оценки генетических ресурсов берёзы. Показано, что ДНК-анализ с помощью 12 микросателлитов наиболее подходит для внутривидовой дифференциации селекционно-ценных генотипов данной породы деревьев. Выявлен генетический полиморфизм у изученных генотипов берёзы по исследованным SSR локусам. Составлены мультилокусные генетические паспорта для 31 исследованного образца березы, позволившие на основе наличия (1) / отсутствия (0) 36 аллелей идентифицировать исследованные образцы.
береза, Betula, генотипирование, микросателлиты, SSR, полиморфизм, ПЦР, паспортизация
1. Zienkiewicz E. Genome fingerprinting by simple sequence repeats (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification [Text] / E. Zienkiewicz, A. Rafalski, В. Labuda // Genomics. – № 20. – P. 176-183.
2. Microsatellite sequences: a new generation of molecular markers for forest genetics [Text] / F. Lefort, C. Echt, R. Streiff, G. G. Vendramin // Forest Genetics. – 1999. – № 6 (1). – P. 15-20.
3. Järvinen P. Nucleotide variation of birch (Betula L.) species: population structure and phylogenetic relationships [Text] : PhD diss. / P. Järvinen. – Joensuu, 2004. – 138 p.
4. Изучение генетической структуры популяций карельской березы в Республике Карелии с помощью микросателлитного анализа [Текст] / Л. В. Ветчинникова, А. Ф. Титов, Л. В. Топчиева, Н. Л. Рендаков // Проблемы объектов лесной науки: современное состояние и перспективы. – Воронеж, 2014. – С. 10–12.
5. Оценка генетического разнообразия популяций карельской березы в Карелии с помощью микросателлитных маркеров [Текст] / Л. В. Ветчинникова, А. Ф. Титов, Л. В. Топчиева, Н. Л. Рендаков // Экологическая генетика. – 2012. – Т. 10. – № 1. – С. 34–37.
6. Исаков И. Ю. Генотипирование селекционных форм лиственных древесных растений с использованием баз данных сиквенсов ДНК [Текст] / И. Ю. Исаков // Проблемы объектов лесной науки: современное состояние и перспективы. – Воронеж, 2014. – С. 42–43.
7. Population history, genetic variation and conservation status of the endangered birch species Betula nana L. in Poland [Text] / K. A. Jadwiszczak, D. Drzymulska, A. Banaszek, P. Jadwiszczak // Silva Fennica. – 2012. – № 46 (4). – P. 465–477.
8. Genetic diversity and genetic structure of adult and buried seed populations of Betula maximowicziana in mixed and post-fire stands [Text] / K. Uchiyama, S. Goto, Y. Tsuda, Y. Takahashi, Y. Ide // Forest Ecology and Management. – 2006. – № 237. – P. 119–126.
9. Kulju K. K. M. Twenty-three microsatellite primer pairs for Betula pendula (Betulaceae) [Text] / K. K. M. Kulju, M. Pekkinen, S. Varvio // Molecular Ecology Notes. – 2004. – № 4. – P. 471–473.
10. Isolation and characterization of microsatellite markers in the tetraploid birch, Betula pubescens ssp. tortuosa [Text] / C. Truong, A. E. Palmé, F. Felber, Y. Naciri-Graven // Molecular Ecology Notes. – 2005. – № 5. – P. 96–98.
11. Isolation and characterization of 19 microsatellite markers in a tropical and warm subtropical birch, Betula alnoides Buch.–Ham. ex D. Don [Text] / J. J. Guo, J. Zeng, S. L. Zhou, Z. G. Zhao // Molecular Ecology Resources. – 2008. – № 8 (4). – P. 895–897.
12. Gürcan K. Transferability of microsatellite markers in the Betulaceae [Text] / K. Gürcan, Sh. A. Mehlenbacher // J. Amer. Soc. Hort. Sci. – 2010. – № 135 (2). – P. 159–173.
13. Cross-species amplification of Betula pendula Roth simple sequence repeat markers in Alnus species [Text] / A. Zhuk, I. Veinberga, M. Daugavietis, D. Ruņģis // Baltic Forestry. – 2008. – № 14 (2). – P. 116–121.
14. Исаков Ю. Н. Интеграционно-эпигенетическое происхождение карельской берёзы: гипотеза и факты [Текст] / Ю. Н. Исаков, Н. М. Соустова, И. Ю. Исаков // Структурные и функциональные отклонения от нормального роста и развития растений под воздействием факторов среды. – Петрозаводск, 2011. – С. 98–103.
15. Palmé A. Evolution history and chloroplast DNA variation in three plant genera: Betula, Corylus and Salix. The impact of post-glacial colonisation and hybridization [Text] : Comprehensive summaries of dokt. diss. / A. Palmé. – Uppsala, 2003. – 59 p.
16. Linkage map of birch, Betula pendula Roth, based on microsatellites and amplified fragment length polymorphisms [Text] / M. Pekkinen, S. Varvio, K. K. M. Kulju, H. Kärkkäinen, S. Smolander, A. Viherä-Aarnio, V. Koski, M. J. Sillanpää // Genome. – 2005. – № 48. – P. 619–625.
17. Doyle J. J. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue [Text] / J. J. Doyle, J. L. Doyle // Phytochem Bull. – 1987. – № 19. – P. 11–15.